Чего только для попон не используют! И мембранный полар-флис, и тефлон, и кучу разной другой лабуды. Пока ничего лучше натуральной шерсти (сукна) я не встречала.
Если лошадь обросшая, то все попоны до одного места. Если она бритая, то да, нужно накрывать. Обратитесь к Жукам в Днепр - они Вам и из флиса, и плащевки и из шерсти пошьют и с плечами попону, и без. И даже с капором!